Los tratamientos utilizados actualmente tienen como objetivo erradicar la bacteria para evitar complicaciones más graves y se basan en la combinación de antibióticos y medicamentos para proteger el estómago. “Sin embargo, los tratamientos destinados a erradicar el Helicobacter pylori fracasan en alrededor del 25 por ciento de los casos, normalmente debido a bacterias resistentes a alguno de los antibióticos utilizados”, explica Iñaki Comas, líder del estudio publicado en “The Lancet Microbe” e investigador del CSIC del Instituto Valenciano de Biomedicina (IVB). Es decir, uno de cada cuatro tratamientos para erradicarla no es efectivo porque la bacteria se ha vuelto resistente a los antibióticos.

Sin embargo, el equipo de Comas, en colaboración con científicos del Centro Nacional de Referencia de Campylobacter y Helicobacter (Francia), ha desarrollado un nuevo método basado en secuenciación genómica que predice con precisión la resistencia del «Helicobacter pylori» a los antibióticos clave del tratamiento, permitiéndonos saber de antemano cuál será la mejor terapia para cada paciente. Un tratamiento a medida para cada paciente.

Difícil de reproducir en el laboratorio.

Tradicionalmente, la técnica de laboratorio utilizada para determinar la posible resistencia de las bacterias a determinados fármacos es el cultivo bacteriano. Este método consiste en cultivar una bacteria, es decir proporcionarle un entorno óptimo para que se multiplique, y obtener así una población bacteriana lo suficientemente grande como para facilitar el diagnóstico. El problema en el caso de H. pylori es que este proceso es particularmente difícil y no es fácil reproducir los resultados entre laboratorios.

En este contexto, los responsables del nuevo estudio diseñaron un método que, en lugar de cultivar la bacteria, utiliza la secuenciación genómica para identificar mutaciones específicas que avanzan en la resistencia a la claritromicina y al levofloxacino, dos de los antibióticos utilizados contra H. pylori.

«Aunque se requiere un cultivo positivo (confirmación de presencia bacteriana en una muestra) para obtener el genoma de la bacteria, no son necesarios cultivos adicionales para identificar resistencias, ahorrando tiempo y recursos. Además, el método es más preciso y reproducible, evitando errores asociados a las pruebas tradicionales», subraya Álvaro Chines, investigador de la Fundación para la Promoción de la Salud y la Investigación Biomédica de la Comunidad Valenciana (Fisabio) y también autor principal del estudio.

Con estos resultados crearon un catálogo de mutaciones genéticas que permite diagnosticar la resistencia sólo con un análisis para conocer su genoma. Además, estimaron la prevalencia global de estas resistencias, revelando diferencias significativas entre las regiones del mundo. Así, concretamente, se encontró que hasta el 51,2 por ciento de las cepas eran resistentes a la claritromicina en el sudeste asiático, mientras que la resistencia a la levofloxacina era inferior al 13 por ciento. Por el contrario, más de la mitad de las cepas del sur de Asia eran resistentes a la levofloxacina, pero menos del cinco por ciento eran resistentes a la claritromicina.

Aplicación escalable

Según los investigadores, esta técnica permite una aplicación global y escalable, ya que puede integrarse en plataformas de diagnóstico genómico y adaptarse a las necesidades de cada región. “Esta tecnología se puede utilizar en el diagnóstico clínico para seleccionar el tratamiento más adecuado desde el principio”, subraya Comas. Según él, la implementación paulatina de la secuenciación genética en los hospitales, especialmente desde la pandemia de Covid-19, donde este tipo de herramienta comenzó a utilizarse con mayor frecuencia, permitiría integrar este análisis para H. pylori. Es decir, los métodos utilizados para detectar el coronavirus ahora podrían adaptarse para estudiar el ADN de esta bacteria gástrica en cada caso.

Asimismo, agregó que el método es útil para realizar vigilancia epidemiológica de resistencia a antibióticos y para el desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas. A largo plazo, los investigadores confían en que esto podría ayudar a reducir los fracasos del tratamiento y mejorar el control de las infecciones por Helicobacter pylori en todo el mundo.